息子に相続させる遺産を書いたとき、自分より先に息子が亡くなった場合はどうなりますか？

その遺産は、改めて相続人全員で遺産分割協議をする必要があります。
方策として、先に息子が亡くなった場合は誰に相続させるか、遺言書に予備的に書くことができます。